Nei casi di IAP che sono refrattari alla terapia medica si può tentare una settostomia atriale con pallone nel corso di una procedura di cateterismo cardiaco. Questo trattamento palliativo ha come scopo di ridurre il sovraccarico delle sezioni destre e consentire un adeguato ritorno venoso a livello delle sezioni sinistre.  L’intervento viene effettuato con la tecnica del cateterismo trans-settale, utilizzando dei palloni da valvuloplastica di grandezza crescente, cercando di ottenere uno shunt destro-sinistro senza desaturazioni eccessive (si cerca di mantenere una saturazione arteriosa intorno al 90%). Con questa tecnica si ottiene una riduzione significativa delle pressioni atriali destre ed un aumento della portata sistemica tale da controbilanciare la desaturazione con conseguente aumento del trasporto di O₂ in periferia.[i]

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